Det grenseoverskridende ved Rune Slagstads intellektuelle virke har ifølge Francis Sejersted gjort ham til «en akademisk vagabond.»: «Slagstads virke som akademiker har en klar indre sammenheng, men lar seg vanskelig plassere innenfor noen av de tradisjonelle disipliner.» Dette blir tydelig illustrert gjennom de fem bøkene som er samlet i «Slagstads Kube». De nasjonale strateger, (Sporten), Rettens ironi og Profesjonshistorier er alle fire historisk forankrede samtidsstudier av det moderne Norge, med materiale fra høyst ulike samfunnsfelt: politikk og arkitektur, teologi og idrett, skole og. billedkunst, sosiologi og rettsliv. I Elster og sirenenes sang, som er i en litt annen genre, blir Jon Elster, et ledende navn i moderne filosofi og samfunnsvitenskap, gjort til gjenstand for inngående disseksjon.
Blant Rune Slagstads øvrige utgivelser kan nevnes: Constitutionalism and Democracy (m/J. Elster, 1988), Dannelsens forvandlinger (m/O. Korsgaard, L. Løvlie, 2003), Utvalgte polemikker (2005), Kunnskapens hus (2006), Spadestikk (2012) og Tilløp til offentlighet (2015). Han var medredaktør for PaxLeksikon 1-6 (1978-81), redigerte for Universitetsforlaget Det Blå Bibliotek (42 titler), tok i 1984 initiativ et til Nytt Norsk Tidsskrift og var dets redaktør 1984-2009. Han har vært professor i ulike disipliner ved Universitet i Oslo og ved Høgskolen i Oslo og Akershus og er nå tilknyttet Institutt for samfunnsforskning (Oslo). I 1996 ble han tildelt Fritt Ords Honnør. Han har vært medlem av Det Norske Videnskaps-Akademi siden 2002.
